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t-SNE

该方法是一种非线性降维方法,将高维数据局部结构保留并映射到低维空间。

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t-SNE聚类结果图矢量图(.pdf)、位图(.tif)
结果文档(包含轮廓系数、每个样品的归属)
结果解读简报
方法相关参考文献
所用R包

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价格

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分析结果图(根据示例数据得到)

t-SNE Analysis Result 1

示例数据

示例文件 1: t_SNE_data.csv

IDFeature1Feature2Feature3Feature4
1.005.103.501.400.20
2.004.903.001.400.20
3.004.703.201.300.20
4.004.603.101.500.20
5.005.003.601.400.20

📊 数据说明

  • 数据须为csv格式(Excel-另存为csv)
  • 数据第1列必须为样品名(标签名),其余变量用于聚类,不区分自变量因变量
  • 所有列名、分组名只能由数字、字母组成,不可有标点符号、空格、中文、希腊字母(α、β)
  • 请确保所有数据为阿拉伯数字,不要包含百分号(%)、单位(如 mg/L)、'<'等字符
  • 数据须为连续变量而不是类别变量,且不可有缺失值
  • 所有变量行数必须相等